我只想当一个安静的学霸
时间:2023-05-26 来源: 作者:术小城
未开垦之地,有可能蕴含着宝藏。
韩猛选择的样本是普通组的大鼠,他采用错配编辑法尝试编辑普通组大鼠的shank3基因。
包括沈奇在内,中心生物实验室的全体成员通过实验观察得到结论:聪明鼠、普通鼠、笨蛋鼠,它们的shank3基因在分子层面看上去并无差异。
既然分子水平上的核酸、蛋白质无差异,那为啥能断定shank3基因在一定程度上影响着大鼠的智商?
这个课题研究可谓一环套一环,密码中隐藏着新的密码。
破解密码最有效或许也是最耗时的方式是做实验,不断的做实验。
韩猛首先在亲链与子链之间进行碱基对检测,以求找到大鼠特殊的碱基成员。
巴掌大小的新型碱基对检测仪高效的运行着,实验室里共有5台,5位实验员人手一台。
五台新型碱基对检测仪也是找华汉基因购买的,一共花了沈奇近一千万人民币的经费。
这个产品总体上值这个价钱,你给它一点细胞,它能在你吃午饭的时间内测完你的三十亿个碱基对。
人类两万多个基因含有约三十亿个碱基对,华汉基因新型碱基对检测仪的检测对象包括人类、鼠、犬、猫、猴……你也可以使用这台仪器对比你和香蕉的碱基对,你会发现你和香蕉的基因有60%是一样的。
目前来说,沈奇科研中心生物实验室只有投入,没有产出。
对韩猛的基因修改实验做是做了,却未形成可以发表的论文。
“希望这次对大鼠的实验,能产出一些可供报道的学术成果吧。沈主任压力其实蛮大的,咱们几个要为他分忧。”崔华林同样在做碱基对检测,沈奇这段时间往实验室里砸了多少钱,他看在眼里,记在心中。
我只想当一个安静的学霸 708章 谢谢你们的理解,谢谢你们的配合
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韩猛开始编辑大鼠的shank3基因,此时大鼠的核苷酸子链尚未甲基化,而互补的亲链含有甲基化团。
这些甲基化是非突变的,与大鼠正常的核苷酸具有相同的配对特性。
由于dna复制与子链的甲基化之间有一个时间差,这给了韩猛扫描错配的碱基提供了机会。
在生物体外无细胞系统中以dna为模板,模仿生物体内控制转录的基因,这样的操作是很烧钱的。
昂贵的精密仪器是实验室的固定资产,随着时间的推移,这些固定资产在折旧。加上各种原料、耗材、水电的消耗,五位实验员做一天实验,甭管有没出成果都要花掉几万块钱。
随着实验进度的深入,钱会越烧越多。
中心生物实验室今年的科研预算是3亿人民币,第一季度刚刚结束,已经花了一亿多。
烧了钱还不一定能出成果,生化材环四大坑或许就是这么个意思。
国家给的科研经费、沈奇在外面拉的赞助,五位实验员们傻傻分不清楚,他们所清楚的是,这间实验室的烧钱程度是国际级的。
华汉基因的实验室更烧钱,其烧钱程度是沈奇实验室的n倍。
但大学里的实验室跟外面的企业不能做对比,这没法比。
做生物研究,若没有充裕的资金,研究者根本无法实现学术理想和人生梦想。
一间实验室的老板,其最重要的任务之一就是打钱。
五位实验员能体会到,沈主任不容易,沈主任有压力,沈主任为了打到更多的钱以维持生物实验室的运作,他四处奔波,不辞辛劳。
中心物理实验室目前已实现了盈亏平衡,他们所创造的专利价值收回了投入成本,甚至还小有盈余。
化学实验室主要研究化学药物,他们收回成本的周期较长,现在处于投入大于产出的奋斗阶段。
中心的五条生物狗当前能做的是,尽快拿出一些有价值的、被生物界广泛认可的、能创造财富的研究成果。
韩猛想要出成果的欲望最为强烈,他冷静细致的操作仪器,观察分子层面的实验进度。
“muts识别错配的碱基,muth通过与未甲基化的5’-gatc-3’序列结合,识别了2条不同的单链……mutl的作用不明显啊,应该是协调其他两个蛋白的活性,使muth结合在由muts所识别的错配位点附近所造成的偏差?”
韩猛做实验室的过程也是一个不断思考的过程,研究大鼠智商基因这个课题项目中存在许多难点和谜题。
解决难点、破解谜题,需要实验员们从大量实验数据中总结经验,并敏锐的发现那把关键的钥匙。
一条路走不通,那就换一条试试。
同样是采取错配编辑法,但韩猛的编辑路径做出了调整。他控制muth切断与甲基化序列连接的g碱基5’磷酸酯键,dna解旋酶随之将双链解开,然后由外切核酸酶降解暴露的单链,一直进行到错配位点的下游。
其他四位兄弟采用不同的编辑方法尝试着不同的实验路线,辅以计算机分析,每人拿出了一套他们自己认为可行的初步方案。
是否真的有效,需要有请大鼠出场。
大鼠即大白鼠,沈奇团队饲养的是在动物实验里运用最为广泛的wistar大鼠。
饲养房在生物实验室隔壁,此处恒温恒湿,有吃有喝,大鼠的居住条件和生活质量保持在较高水准。
wistar雌鼠在哺乳期很凶,常会主动咬工作人员喂饲时伸入鼠笼的手。
而在通常情况下,这些大鼠比较温顺,可于一笼内大批饲养。
韩猛等五位实验员进入饲养房,聪明组的大鼠蠢蠢欲动,前爪离地搓呀搓,似乎做出一副讨好的样子。
普通组的大鼠咕溜溜转动小眼珠,小鼻子动了动嗅着什么,它们感觉到了非同类生物的到来。
笨蛋组大鼠傻呆呆的挤成一团,无动于衷。
万物皆有灵性,研究动物的人首先要做到了解动物。
崔华林在普通组大鼠的笼子前观察它们,他提议道:“对它们进行基因编辑之前,请它们吃顿好的吧。”
“这是应该的。”韩猛点点头,这便安排大鼠们吃好的。
实验白鼠的饲料有国家标准,这些大鼠平时吃符合国标的白鼠饲料。
白鼠饲料虽然营养丰富,但口味选择较少,吃来吃去就那么一两种味道。
这些大鼠最爱吃的是新鲜的卷心菜、黄瓜、苹果、葵瓜子、黑加仑、车厘子等果蔬。
五位实验员各自挑选一笼普通组大鼠,请他们的小伙伴吃新鲜果蔬。
吃到美食的普通组大鼠们挺开心的,它们来回跳动,并发出爽朗的笑声。
虽然听上去都是吱吱声,但仔细辨认,你会发现频率不同的吱吱声代表了大鼠们不同的心情状态。
“吃吧,多吃点。”崔华林继续喂食他的小伙们新鲜果蔬,他在生物专业学习、工作了这么多年,背负了不止一条的鼠命。
其他四个兄弟手上的鼠命更多,他们拿白鼠做了很多实验,他们尊重这些小动物,他们尊重生命。如果非要处死实验鼠,他们尽量选择痛苦程度最低的处理方法。
相比于承担着药物实验、细菌实验、病毒实验、放射性实验、病理实验的白鼠,这些用于智商基因实验的白鼠在它们短暂的一生中几乎不会感受到痛苦。
“吃好了吧?”韩猛询问笼子里的小伙伴。
小伙伴们答复:“吱吱!”
“那咱们开始实验?”
“吱!”
“谢谢你们的理解,谢谢你们的配合。”
五位实验员把他们的小伙伴请出笼子,移步到隔壁的生物实验室。
大鼠们在实验台上先被麻醉,而后实验员们操作基因编辑设备,对大鼠们进行shank3基因编辑。
韩猛按照他在体外无细胞系统中得到的实验方案,对他挑选的实验鼠进行生物体实验。
“识别靶位碱基……”
“切除非甲基化链……”
“校正错配碱基……”
实验进行的很顺利。
实验鼠在睡眠中被实验员们实施了shank3基因编辑手术。
“我做完了。”
“我也做完了。”
“接下来,让我们一起期待奇迹的发生吧。”
我只想当一个安静的学霸 709章 很靠谱啊
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五位实验员进入了观察阶段。
五组大鼠被编号为韩猛组、崔华林组、唐亚星组、杜源组、武俊强组,其中雌雄各一半。
奇迹暂时没有发生,但悲剧很快发生了。
杜源组大鼠的麻醉效果结束后,它们在一天内陆续死去。
实验记录为:
杜源组1号鼠,死于12点42分,颅内出血。
杜源组2号鼠,死于12点43分,颅内出血。
……
杜源组10号鼠,死于12点51分,颅内出血。
确切的说,杜源组的10只实验鼠在十分钟内陆续死亡,平均一分钟死掉一只。
死因相同,皆为颅内出血而亡。
“哎,我失败了。”杜源好生懊恼,他的实验方案被证明彻底失败,他的十位小伙伴还没来得及做智商测试便暴毙而亡,惨死于实验室里。
杜源只能懊恼一分钟,他必须争分夺秒的解剖死去的10只实验鼠,主要工作内容是解剖分析实验鼠的脑组织,总结经验教训,为下一次的实验设计积累宝贵数据。
对活体进行基因编辑实验确实存在风险。
杜源只不过是修改了实验鼠的一种基因,就导致他的实验鼠在极短时间内全军覆没。
“兄弟,别泄气,失败乃成功之母。”韩猛安慰着杜源,他又道:“你尽快整理出你这组实验数据的分析报告,并给出你的结论,到底是同源重组编辑法有问题,还是你基于这种方法的路径选择有问题?我们现在只能采取排除法了,一个个的试错,直到找到相对正确的那种方法和具体路径。”
杜源总结经验教训的同时,其他四位实验员则继续观察他们组的大鼠。
不久后,沈奇加入了观察者行列,他注意到,崔华林组的大鼠变的很狂躁,这组大鼠见谁咬谁,咬不到人就咬同类,咬不到同类就咬笼子的金属网。
“吱吱吱!”
崔华林组大鼠龇牙咧嘴面目狰狞,现在的它们不爱新鲜果蔬,它们只想咬活的东西。
“哎,我失败了。”崔华林叹气道,他的小伙伴在基因编辑后极为疯狂,根本没法做智商测试。最疯狂的那只大鼠,竟将它自己的前脚咬断了。
血腥味令这只大鼠愈发疯狂,它猛烈撞击金属网,试图冲破牢笼去撕咬笼子外的活物。
沈奇拍了拍崔华林的肩膀:“提取活体细胞、脑组织保存,然后处死吧。”
“沈主任,要不咱们再观察一段时间?”崔华林不甘心就这么失败,他仍然存有一线希望。
沈奇摇摇头:“不用继续观察了,处死你这组的全部实验鼠。我想要看到它们的原始数据,不出我预料的话,对它们的shank3基因修改影响到了它们的神经元,这种影响是不可逆的,它们恐怕会变的更加疯狂。”
“好吧……”崔华林含泪处死了他的小伙伴。
处死之前,崔华林先采用雾化麻醉方法将他的小伙伴弄晕,提取活体细胞,然后脱臼处死,解剖处理,保存各类器官及脑组织。
好消息一个都没有,坏消息陆续产生。
唐亚星组的大鼠未体现出疯狂的侵略性,但它们变的极其自闭,它们蜷缩在笼子角落一动不动,犹如长了毛的静止鼠标。
“你这组自闭的实验鼠无法进行后续实验,提取活体细胞、脑组织保存,然后处死吧。我想要看到它们的原始数据。”沈奇下达了指令。
“可惜啊,可惜。”唐亚星摇头叹气,遂处死了他的小伙伴。
目前有一组大鼠因自身原因死掉了,另外两组表现异常的大鼠被实验员处死。
人类科学的进步,离不开这些实验动物作出的贡献。
科学研究仍在持续,大鼠们在其短暂的一生中继续为人类科学进步做贡献。
经观察和各种体检,韩猛组和武俊强组的实验鼠在身体指标和动物行为方面暂时正常,可以进行t迷宫测试。
也不知道是好消息还是坏消息,武俊强组的实验鼠的t迷宫测试成绩和之前保持一致。
这组大鼠在t迷宫中遇到t字型路口,它们的选择永远是向右走。
绝大多数啮齿类动物都有单向偏爱的特性,沈奇团队选用的wistar大鼠偏爱向右。
武俊强设计的t迷宫路线是十八右一左。
wistar大鼠连续向右18次,然后向左一次,就能走出迷宫,从而获取到放置于迷宫出口的食物。
武俊强组大鼠的空间学习能力并未变强,它们相当头铁,它们一直向右绝不向左。
也就是说,经过shank3基因编辑的武俊强组实验鼠,其智商保持不变,依旧是普通水平。
“武俊强组的实验鼠,值得继续研究。”沈奇做出了上述指示。
“好的,明白!”武俊强兴奋的搓搓手,他的小伙伴暂时不会被处死,他的实验方案未被证明是最合适的方案,却也没被彻底否定。
五位实验员亲自挑选他们的大鼠,亲自照顾,亲自喂养,他们对自己的小伙伴多多少少有些感情。
片刻的生命亦是生命,若能给小伙伴一条活路,哪怕是多活几天,实验员们也不愿立即亲手处死它们。
处死了三十只大鼠,保留了十只大鼠,目前来说情况最好的是韩猛组大鼠。
韩猛设计了一条全新的t迷宫路线,他的前三只实验鼠在该迷宫中取得的成绩,优于它们接受shank3基因编辑之前的成绩。
“韩猛的这组实验鼠,很有希望啊。”沈奇终于等来了一个看似不错的好消息。
“猛哥这组大鼠,学习能力变强了啊!”其他实验员们纷纷围观。
韩猛组的4号大鼠进入了t迷宫,它是一只雌鼠。
经科学家验证,wistar大鼠这个品类的雌鼠比雄鼠更聪明。
为啥雌鼠更聪明,其本质原因还需要进一步确认。
但即便是聪明的wistar雌鼠,它们的右向偏爱性仍然明显。
做基因编辑之前,韩猛组4号雌鼠只能走出全右向的t迷宫。
在这个新的t迷宫中,韩猛设置了两个左向正确的t字路口。
前面三只雌鼠失败了几次之后,记住了正确路线和错误路线,它们走出了迷宫,吃到了食物。
4号雌鼠的表现更加优异,它只失败了两次,便走出了迷宫。
4号雌鼠的右向偏爱性依旧是主要特性,但与此同时,它的学习能力显著变强。
当它意识到向右走得不到食物时,它会做出改变,在同一个路口选择向左。
崔华林啧啧称奇:“4号鼠相当聪明!一个路口失败一次,它就能记住左向是正确的,并在下一次尝试中选择向左!猛哥,看来你的基因编辑方法,很靠谱啊!”
我只想当一个安静的学霸 710章 其他研究团队切勿模仿
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韩猛组的10只实验鼠在t迷宫中表现优异,韩猛将对他的小伙伴做进一步的研究。
五位实验员把他们实验鼠的原始数据整理了出来,给到了沈奇。
沈奇通过数理化生相结合的方法,对原始数据进行深入分析。
杜源组大鼠修改了shank3基因后,它们在短时间内全部死于颅内出血。
杜源的编辑方案为啥会导致大鼠颅内出血?
关于这点,沈奇也没想明白,需要他继续研究。
崔华林、唐亚星的编辑方案,使他们的实验鼠变的异常狂暴或自闭。
关于这点,沈奇分析出了大致的原因。
按照崔华林、唐亚星的编辑方案,shank3基因修改后,在很短时间内引发大鼠基因发生新的突变,致使大鼠神经系统受到不可逆的破坏。
上述三组实验失败了。
从失败中,沈奇总结出两字:密码。
密码又是什么?它在哪里?它该如何控制?
从大到小一层层剥离,细胞核里含有染色体,染色体由dna和组蛋白构成。
dna在早期被认为是蛋白分子,后被证实,dna其实是脱氧核糖核酸分子。
基因是一段包含遗传信息的dna序列,它的编码即是遗传信息,它通过转录和翻译生成蛋白质来表达它所携带的信息。
一个有机体的生长由连续的细胞分裂引起,在细胞有丝分裂过程中,染色体被复制了。
与此同时,密码传递下去,也有可能产生新的密码。
沈奇认为密码本隐藏在染色体的纤丝结构中,密码可以被书写与阅读,那么关键的问题是,细胞如何选择组蛋白以及采取哪种方式来书写阅读密码呢?
为了掌握生物密码的精确操作原理,沈奇先研究基因,后面会是dna和蛋白质,再然后是染色体、细胞。
研究基因难就难在基因突变,沈奇觉得运用纯粹的生物学方法解决不了这个问题。
t=te^w/kt
沈奇写下了这个公式。
这是个未被证明的公式,学术界称之为“突变可能性公式”。
普朗克在1900年发现了量子论,德弗里斯、柯林斯和丘歇马克于1900年重新发现孟德尔的论文,以及德弗里斯在1901年至1903年期间发表的关于突变的论文,由此可以看出,量子论和现代遗传学几乎是同时产生的。
量子论和遗传学之间有联系吗?
沈奇认为,这两种学科均发展到较高程度时才会产生联系。
时至今日,量子论和遗传学已经发展到了较高程度。
因而产生了一种新的学派---量子生物学。
量子生物学家试图通过量子理论来解释突变。
突变可能性公式中的t即阈能w的突变的期待时间。
量子生物学派尚未证明t=te^w/kt的普适性,因此这个公式暂且称为“突变可能性公式”,而非“突变公式”。
“阈值就是解释生物学遗传性持久性所需的数量级……”
沈奇凝眉思考,他继续分析韩猛组、武俊强组的大鼠实验数据。
没过多久,武俊强愁眉苦脸的说:“沈主任,有个坏消息,我的实验鼠的智商下降了,它们只能走出全右向的迷宫,但在其他方面,它们变的跟笨蛋鼠一样愚蠢。”
沈奇并不这么认为:“不,这不是坏消息,这是个利好消息。”
武俊强有些不理解:“通过基因编辑导致实验鼠降低智商,这是个好消息?”
沈奇说出了他的观点:“通过基因手段调控智商,所谓的调控,应该是可调高亦可调低,这才是一套完整的操作流程。当然了,我们更倾向调高智商,但也不可否认调低智商的学术价值。在一些特定的情况下,降低实验目标的智商,或许实际用途更大。”
武俊强身子一抖:“降智打击?”
沈奇微微一笑:“小强,你对t=te^w/kt的了解有多深?”
“这是量子生物学派提出的突变可能性公式吧,我倒是对它有所了解,我在国外的导师痴迷于量子生物学,我对这个公式是这么理解的……”
经过一番交流,武俊强豁然开朗,他开始起草论文。
论文的标题是《多种shank3基因编辑方法的大鼠研究》。
摘要大意为:“研究表明,啮齿类动物的智商在一定程度上受shank3基因影响,本课题组选用wistar大鼠为实验对象,通过错配编辑、核苷酸切除编辑、碱基切除编辑、同源重组编辑、非同源末端连接编辑等方法对实验大鼠进行shank3基因编辑,取得了初步的研究进展。”
其他四位实验员也加入了论文编写的行列。
韩猛在他所负责的论文部分中写到,通过错配编辑法,使得实验大鼠的智商明显提高。并列出了主要的实验数据,进行了原因分析。
武俊强在他所负责的论文部分中写到,通过碱基切除编辑法,使得实验大鼠的智商有所降低。并列出了主要的实验数据,进行了原因分析。
崔华林、唐亚星、杜源也给出了他们的实验数据和实验结果。
导致实验鼠颅内出血、狂暴、自闭的真正原因,崔华林、唐亚星、杜源不得其解。这部分失败教训的原因分析由沈奇主笔。
在大家的勤奋努力下,《多种shank3基因编辑方法的大鼠研究》很快写完了。
看上去有些仓促,但沈奇认为可以先发表。
动物实验有许多种类,比如说口服或注射药物在动物身上的实验,其实验周期是药效周期及动物的代谢周期。
而基因编辑在动物身上的实验,其实验周期应该是动物的正常生命周期,乃至要考虑到一代或者几代实验动物子代的生命周期。
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